HP 晶格蛋白质的态密度
软凝聚态物质
2007-10-23 v1
摘要
态密度包含了统计系统所有能量量的信息，例如平均能量、自由能、熵和比热。作为具体应用，本文考虑了一种用于研究蛋白质统计性质的简单异聚合物晶格模型。对于短链，我们通过构象枚举导出了精确结果；而对于长链，我们开发了一种基于 nPERM 链增长方法的多正则蒙特卡洛变体，以直接模拟态密度。为简化起见，仅考虑两种分别具有疏水 (H) 和极性 (P) 残基的单体类型，且仅计入沿链不相邻的疏水单体之间的次近邻相互作用。这被称为用于晶格蛋白质折叠的 HP 模型。
引用
@article{arxiv.0710.4074,
title = {Density of States for HP Lattice Proteins},
author = {Michael Bachmann and Wolfhard Janke},
journal= {arXiv preprint arXiv:0710.4074},
year = {2007}
}
备注
9 pages, 4 figures