TumorHoPe2：一个更新的肿瘤归巢肽数据库
生物大分子
2025-05-28 v1
摘要
为了满足对肿瘤归巢肽（THP）有序数据日益增长的需求，我们推出了 TumorHoPe2，这是一个经过人工审编的数据库，提供了关于经实验验证的 THP 的广泛细节。这是对我们在 2012 年最初开发的 TumorHoPe 的重大更新。TumorHoPe2 现包含 1847 条条目，代表 1297 条独特的肿瘤归巢肽，较其前身的 744 条条目有了大幅扩充。对于每条肽，该数据库提供了关键信息，包括序列、末端或化学修饰、对应的癌细胞系以及靶向的特定肿瘤类型。该数据库汇编了来自两个主要来源的数据：噬菌体展示文库（通常用于鉴定靶向肿瘤特异性标志物的肽配体）和合成肽（通过化学修饰以增强稳定性、结合亲和力和特异性等特性）。我们的数据集包含 594 条化学修饰的肽，其中 255 条具有 N 端修饰，195 条具有 C 端修饰。这些 THP 已针对 172 种癌细胞系进行了验证，并展示了对 37 种不同肿瘤类型的特异性。为了最大化对研究社区的实用性，TumorHoPe2 配备了用于数据搜索、过滤和分析的直观工具，以及用于高效编程访问和集成到生物信息学流水线中的 RESTful API。该数据库可在 https://webs.iiitd.edu.in/raghava/tumorhope2/ 免费获取。
关键词
引用
@article{arxiv.2505.20913,
title = {TumorHoPe2: An updated database for Tumor Homing Peptides},
author = {Diksha Kashyap and Devanshi Gupta and Naman Kumar Mehta and Gajendra P. S. Raghava},
journal= {arXiv preprint arXiv:2505.20913},
year = {2025}
}