120万分子2000万 conformers的开放量子化学性质数据库
化学物理
2024-10-28 v1
摘要
人工智能正在革新计算化学,为该领域带来前所未有的创新和效率。为进一步推进研究并加速进展,我们介绍了量子开放有机分子 (QO2Mol) 数据库——一个旨在为有专业需求和变革性研究在有机分子科学领域提供的大规模量子化学数据集,采用开源许可证。该数据库包含120,000个有机分子和约2000万个 conformers,涵盖10种元素 (C, H, O, N, S, P, F, Cl, Br, I),重原子数超过40。运用高精度B3LYP/def2-SVP量子力学水平,对每个构象进行精细计算,计算包括势能和力。这些分子来源于ChEMBL中化合物的片段,确保其结构与实际化合物的相关性。其广泛的分子结构覆盖范围和多样化的元素组成,使其能够进行全面的结构-性质关系研究,增强机器学习模型在预测分子行为方面的准确性和适用性。QO2Mol数据库和基准代码已公开于 https://github.com/saiscn/QO2Mol/。
引用
@article{arxiv.2410.19316,
title = {An Open Quantum Chemistry Property Database of 120 Kilo Molecules with 20 Million Conformers},
author = {Weiqi Liu and Xi Ai and Zhijian Zhou and Chao Qu and Junyi An and Zhipeng Zhou and Yuan Cheng and Yinghui Xu and Fenglei Cao and Alan Qi},
journal= {arXiv preprint arXiv:2410.19316},
year = {2024}
}
备注
9 pages