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面向医师与研究者的全面且便于用户分析的癌症患者数据库

定量方法 2023-09-26 v1 计算机与社会

摘要

癌症的发生与临床进程受多因素影响,包括患者总体健康状况、种系与肿瘤突变、合并症及环境,因此需要精细的癌症患者照护。为向每位患者有效定制个体化治疗,必须以易获取、易分析的方式向医务人员呈现此类多因素数据。为满足该需求,我们开发了一个关系型数据库,将癌症关键基因突变状态、血清半乳糖凝集素谱、血清与肿瘤糖组学谱,与个体癌症患者的临床、人口统计及生活方式数据点相整合。该数据库作为后端,为医师与研究者提供单一、易访问的癌症分析数据仓储,以辅助并提升个体化治疗。我们的交互式数据库允许照护提供者从这些群体中合并队列,以发现不同数据类型间的相关性,并有可能基于基因突变、血清半乳糖凝集素水平、聚糖组成及患者临床数据与生活方式选择的组合找出“分子特征”。我们的项目为分析跨癌症分期与亚型的分子与临床模式提供了一个集成、交互且不断增长的数据库框架,并为提升诊断与预后能力提供了机遇。

关键词

引用

@article{arxiv.2302.01337,
  title  = {Comprehensive and user-analytics-friendly cancer patient database for physicians and researchers},
  author = {Ali Firooz and Avery T. Funkhouser and Julie C. Martin and W. Jeffery Edenfield and Homayoun Valafar and Anna V. Blenda},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2302.01337},
  year   = {2023}
}

备注

7 pages, 12 figures, peer reviewed and accepted in "International Conference on Computational Science and Computational Intelligence (CSCI 22)"