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面向精准医疗的乳腺癌多阶段聚类

定量方法 2016-12-06 v1 基因组学

摘要

癌症已成为世界上最普遍的疾病之一。具体而言,乳腺癌的诊断频率高于任何其他类型的癌症。然而,乳腺癌患者及其个体肿瘤往往是独特的。识别潜在的遗传表型可以实现精准(个性化)医疗。量身定制的医疗治疗策略以最好地满足个体患者的需求,可以显著改善他们的健康状况。这种方法需要对患者和疾病有充分的了解,而这是目前从业者所不具备的。本研究聚焦于乳腺癌,提出了一种新颖的两阶段聚类方法,将患者划分为层次化群体。第一阶段是粗分组,基于人口统计学信息和临床特征等表型。第二阶段是基于基因组特征(如第一阶段产生的亚组中患者的拷贝数变异和体细胞突变)的细分组。通常,该框架提供了一种混合多种形式数据(包括表型和基因组数据)的机制,以最有效地为个性化预测定义个体患者。该方法提供了检测所有因素之间相关性的能力。

关键词

引用

@article{arxiv.1612.01413,
  title  = {Multi-stage Clustering of Breast Cancer for Precision Medicine},
  author = {Chenzhe Qian},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1612.01413},
  year   = {2016}
}