树状网状网络——树状距离何时也支持网状进化？
种群与进化
2014-09-24 v2
摘要
杂交进化和水平基因转移（HGT）是进化关系可能更准确地由网状网络而非树来描述的过程。在这样的网络中，任意两个现存物种之间通常存在多条路径，反映了遗传物质从共同祖先传递到这些物种的可能途径。这些路径通常具有不同的长度，但仍可计算任意两个分类群之间的“平均距离”。在本文中，我们询问这种平均距离是否能够区分网状进化与纯树状进化。我们考虑两种类型的网状网络：杂交网络和HGT网络。对于前者，我们建立了一个一般性结果，表明现存分类群之间的平均距离可以呈现树状特征，但仅限于根附近的一次杂交事件；在所有其他情况下，这两种进化形式可以通过平均距离区分。对于HGT网络，我们展示了一些类似但更复杂的结果。
引用
@article{arxiv.1405.2965,
title = {Tree-like Reticulation Networks - When Do Tree-like Distances Also Support Reticulate Evolution?},
author = {Andrew R. Francis and Mike Steel},
journal= {arXiv preprint arXiv:1405.2965},
year = {2014}
}
备注
19 pages, 9 figures. Revised version includes clarification in proof of Theorem 2, and a new figure (Fig 9)