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数字视角下的转录调控 2:应用

分子网络 2007-05-23 v1 定量方法

摘要

随着关于基因表达与调控的实验数据不断增加,越来越需要定量模型来描述这些数据并将其与不同背景关联。前文回顾的热力学模型为细菌转录调控的定量分析提供了有用框架。我们回顾了一些被一种或两种转录因子调控的、表征良好的细菌启动子,并将热力学框架应用于这些启动子。我们表明该框架允许使用少量参数来量化极其不同的基因表达形式。因此,它提供了对更高层次研究(例如遗传网络)有用的紧凑描述,而无需援引每个组分的生化细节。此外,它可用于生成关于转录控制可能机制的假说。

关键词

引用

@article{arxiv.q-bio/0412011,
  title  = {Transcriptional Regulation by the Numbers 2: Applications},
  author = {Lacramioara Bintu and Nicolas E. Buchler and Hernan G. Garcia and Ulrich Gerland and Terence Hwa and Jane' Kondev and Thomas Kuhlman and Rob Phillips},
  journal= {arXiv preprint arXiv:q-bio/0412011},
  year   = {2007}
}

备注

15 pages and 9 figures in PDF format