爪树 $K_{1,n}$ 上一般基于群模型的系统发育不变量的环面理想
交换代数
2016-08-14 v3 种群与进化
摘要
我们研究任意爪树上一般基于群模型的系统发育不变量的环面理想这一问题。我们聚焦于群 并选择一种可推广到其他群的自然递推方法。对每个系统发育理想相伴格的研究产生了一组生成相应格理想的回路。此外，我们显式描述了具有任意叶子数的爪树上不变量环面理想的二次字典 Gröbner 基。结合 Sturmfels 与 Sullivant 的一个结果，这意味着群 下每棵树的系统发育理想都有二次 Gröbner 基。因此，该环面簇的坐标环是一个 Koszul 代数。
引用
@article{arxiv.math/0702368,
title = {Toric ideals of phylogenetic invariants for the general group-based model on claw trees $K_{1,n}$},
author = {Julia Chifman and Sonja Petrović},
journal= {arXiv preprint arXiv:math/0702368},
year = {2016}
}
备注
Revised introduction (more complete); revised algorithms; added references. To appear in Proceedings of Algebraic Biology 2007