德热纳区域中RNA模型的拓扑相变
生物大分子
2015-05-13 v1
摘要
我们研究了G. Vernizzi、H. Orland和A. Zee提出的RNA分子简化模型在溶液中正离子强浓度区域的行为。该模型考虑一条由相同碱基组成的柔性链，碱基之间可以沿链任意配对相互作用，同时保持相互作用的饱和性。在所考虑的区域中，我们观察到临界温度T_c的出现，它将两个相区分开，这两个相可以通过主要构型的拓扑结构来表征：在高温区域，分子的主要构型具有非常大的亏格（与分子尺寸同阶），对应于复杂的拓扑结构；而在相反的低温柔区域，主要构型简单且具有球面拓扑。我们确定该拓扑相变为一级相变，并给出了T_c的解析表达式。该模型所研究的区域与de Gennes研究的稠密聚合物系统区域具有相似性。
引用
@article{arxiv.0904.3844,
title = {Topological phase transition in a RNA model in the de Gennes regime},
author = {Matias G. dell'Erba and Guillermo R. Zemba},
journal= {arXiv preprint arXiv:0904.3844},
year = {2015}
}
备注
15 pages, 4 figures