流感的季节性迁徙：时空假设检验的统一框架
种群与进化
2012-10-23 v1
摘要
全球流动数据是用于预测传染病行为的流行病空间模型的核心，但在利用病毒遗传数据重建病原体进化动力学时，这些丰富的人类流动数据在很大程度上被忽视了。尽管病毒进化的随机模型可能由此类数据提供信息，但主要挑战在于决定哪些流动过程是关键的，以及它们在多大程度上有助于塑造病原体多样性的当代分布。在此，我们开发了一个框架，将病毒扩散的预测因子与系统地理推断相结合，在估计人类流感 H3N2 迁徙历史的同时，测试并量化其 underlying 因素。我们提供了证据表明航空旅行支配着人类流感的全球动态，而其他过程则在更局部的尺度上发挥作用。
引用
@article{arxiv.1210.5877,
title = {The seasonal flight of influenza: a unified framework for spatiotemporal hypothesis testing},
author = {Philippe Lemey and Andrew Rambaut and Trevor Bedford and Nuno R. Faria and Filip Bielejec and Guy Baele and Colin A. Russell and Derek J. Smith and Oliver G. Pybus and Dirk Brockmann and Marc A. Suchard},
journal= {arXiv preprint arXiv:1210.5877},
year = {2012}
}
备注
16 pages, 4 figures, 3 tables