整合流感抗原动态与分子进化
种群与进化
2013-12-23 v2 定量方法
应用统计
摘要
流感病毒经历持续的抗原进化，使突变病毒能够逃避宿主对先前病毒株获得的免疫。抗原表型通常通过血凝抑制（HI）试验对流感病毒株之间的交叉反应性进行成对测量来评估。在此，我们扩展了先前的抗原制图方法，并通过在共享病毒系统发育上对抗原表型的扩散进行建模，同时表征抗原和遗传进化。利用来自流感谱系A/H3N2、A/H1N1、B/Victoria和B/Yamagata的HI数据，我们确定了跨病毒谱系的抗原漂移模式，表明A/H3N2比其他流感谱系进化更快且更具间断性。我们还表明，年际抗原漂移似乎驱动了每个流感谱系内的发病率模式。这项工作通过提供一个紧密结合分子和抗原进化的模型，为研究流感和其他抗原可变病原体的动态奠定了未来重大进展的基础。
引用
@article{arxiv.1304.3637,
title = {Integrating influenza antigenic dynamics with molecular evolution},
author = {Trevor Bedford and Marc A. Suchard and Philippe Lemey and Gytis Dudas and Victoria Gregory and Alan J. Hay and John W. McCauley and Colin A. Russell and Derek J. Smith and Andrew Rambaut},
journal= {arXiv preprint arXiv:1304.3637},
year = {2013}
}
备注
32 pages, 13 figures, 2 tables