GC 含量、核小体占据率与外显子大小之间的关系
基因组学
2014-05-29 v2 定量方法
摘要
后生动物内部翻译外显子的平均大小在 120 至 165 nt 之间，约为典型单核小体（147 nt）的大小。全基因组研究也表明，外显子中的核小体占据率显著高于内含子，这可能表明外显子大小的进化与其核小体占据率有关。通过根据侧翼内含子的 GC 含量对外显子进行分组，我们显示平均外显子大小与其 GC 含量呈正相关。利用来自有限核酸酶消化直接定位智人（Homo sapiens）核小体的测序数据，我们显示核小体占据率水平也以类似方式与外显子 GC 含量呈正相关。随后，我们证明了外显子大小与其核小体占据率呈正相关。外显子大小与核小体占据率之间的强相关性表明，染色质组织可能与外显子大小的进化有关。
引用
@article{arxiv.1404.2487,
title = {The relationships among GC content, nucleosome occupancy, and exon size},
author = {Liya Wang and Lincoln Stein and Doreen Ware},
journal= {arXiv preprint arXiv:1404.2487},
year = {2014}
}
备注
26 pages, 9 figures