倍性谱的杂交数

多倍化是指生物体继承其亲本基因组的多个拷贝，这是在植物和动物中观察到的重要进化事件。研究此类事件的一种方式是依据构成感兴趣数据集的物种的倍性数。因此自然会问：从物种的倍性数可以收集到关于构成数据集的物种集合的进化历史的多少信息？为帮助回答此问题，我们引入并研究了倍性谱这一新概念，它使我们能够用按数据集所含物种索引的重数向量来形式化该问题。利用系统发育网络框架，我们给出了计算一大类倍性谱的杂交数（即解释一个倍性谱所需的最少多倍化事件数）的闭式公式。该公式依赖于从倍性谱的简化序列构造特定系统发育网络，以及用此构造初始化的倍性谱的杂交数。在构成倍性谱的倍性数不太大时，这两者均可容易计算。为帮助说明我们方法的适用性，我们将其应用于一个公开可用 Viola 数据集的简化版本。