胞内颗粒运输的首达概率
亚细胞过程
2015-05-13 v1 定量方法
摘要
被运输的胞内颗粒在给定时间 t 或逆速度 S = t/L 内达到位移 L 的首达概率(FPP),可以从测量的颗粒轨迹中稳健地计算出来,并提供了一种颗粒运动的度量,借此可以在单一图表中轻松区分不同类型的运动(例如扩散、弹道运动和瞬态跑-停运动),并与数学模型进行比较。FPP 的吸引力在于它提供了一种缩减测量轨迹数据的方法,而无需对运动机制做出假设:例如,它不使用平滑、分割或任意阈值来区分颗粒轨迹中的不同运动类型。通过获取被追踪的内吞囊泡的实验数据并计算 FPP,我们观察了三种分子处理如何影响运输。我们表明,FPP 可以量化既非完全随机又非完全确定性的复杂运动,使其非常适用于细胞生物学中被运输的颗粒。
引用
@article{arxiv.0904.1972,
title = {The First Passage Probability of Intracellular Particle Trafficking},
author = {Salman S. Rogers and Neftali Flores-Rodriguez and Victoria J. Allan and Philip G. Woodman and Thomas A. Waigh},
journal= {arXiv preprint arXiv:0904.1972},
year = {2015}
}
备注
Article: 13 pages, 8 figures