弹性蛋白样八肽 GVG(VPGVG) 的温度依赖构象转变与氢键动力学：分子动力学研究
生物大分子
2009-11-10 v1
摘要
对弹性蛋白样八肽 GVG(VPGVG) 进行了实验与理论联合研究。本文给出了该八肽温度依赖折叠与去折叠的全面分子动力学研究。当前研究及其实验对应研究均发现，该肽发生“逆温度转变”（ITT），导致在约 310-330 K 发生折叠。此外，在接近水沸点的异常高温下识别出去折叠转变。由于体系尺寸较小，发现了两个宽温度区间：“ITT 区间”（约 280-320 K）和“去折叠区间”（约 T > 330 K），其中肽在约 330 K 处具有最大的折叠概率。给出了涉及热力学序参数或反应坐标的详细分子图像，以及肽内及肽与溶剂水分子之间氢键动力学的时间关联函数分析。讨论了与实验证据的关联及对弹性蛋白性质的影响。
引用
@article{arxiv.q-bio/0401012,
title = {Temperature Dependent Conformational Transitions and Hydrogen Bond Dynamics of the Elastin-Like Octapeptide GVG(VPGVG): a Molecular Dynamics Study},
author = {Roger Rousseau and Eduard Schreiner and Axel Kohlmeyer and Dominik Marx},
journal= {arXiv preprint arXiv:q-bio/0401012},
year = {2009}
}
备注
15 pages, 1 table, 8 figures