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来自弹簧的 TALEs——转录激活因子样效应蛋白结构的超弹性

生物大分子 2015-06-22 v1 软凝聚态物质 生物物理

摘要

采用简单的力探针装置在计算机实验中研究转录激活因子样效应蛋白(TALE)的力学性质。结果表明,其类弹簧排列有利于超弹性行为,表现为沿螺旋轴的大尺度全局构象变化,从而联系了 TALE 蛋白的结构与动力学。从测得的力 - 伸长曲线可以看出,对于适度的全局结构变化,dHax3 和 PthXo1 TALEs 表现为遵循胡克定律的线性弹簧。然而,对于较大的变形,蛋白质表现出非线性,且拉伸越多结构变得越硬。柔性并非均匀分布在 TALE 结构上,而是识别出对应于 RVD 环残基的软点,这些软点是构象运动传递的关键介质。

关键词

引用

@article{arxiv.1406.7603,
  title  = {TALEs from a spring -- superelasticity of Tal effector protein structures},
  author = {Holger Flechsig},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1406.7603},
  year   = {2015}
}

备注

6 pages, 4 figures