单个 TATA 盒结合蛋白对 DNA 的分步弯曲
生物物理
2007-05-23 v1 生物大分子
摘要
TATA 盒结合蛋白（TBP）是所有三种真核 RNA 聚合酶从大多数启动子起始转录所必需的。TBP 识别、结合并弯曲 DNA 中称为“TATA 盒”的启动子序列。我们展示了单个酿酒酵母 TBP 与含有 TATA 盒的单条 DNA 分子相互作用的研究结果。使用视频显微镜，我们观察了由短的表面结合 DNA 系住的微球的布朗运动。当 TBP 结合并弯曲 DNA 时，DNA 的构象发生变化，与未弯曲的 DNA 相比，系住微球的布朗运动幅度减小。我们检测了单个结合和解离事件，并推导了该过程的动力学参数。解离是通过增加盐浓度或使用光镊直接拉动系住的微球来诱导的。除了明确的自由和结合两类布朗运动外，我们还观察到了另外两类运动。这些额外的类别被确定为三步线性结合途径上的中间态。讨论了中间态的生物学意义。
引用
@article{arxiv.physics/0603049,
title = {Stepwise bending of DNA by a single TATA-box Binding Protein},
author = {Simon F. Tolic-Norrelykke and Mette B. Rasmusssen and Francesco S. Pavone and Kirstine Berg-Sorensen and Lene B. Oddershede},
journal= {arXiv preprint arXiv:physics/0603049},
year = {2007}
}
备注
Accepted for publication in: Biophysical Journal