SpliceCombo：一种高效用于剪接位点预测主成分分析的混合技术

基因预测搜索的首要步骤是从基因组 DNA 序列中识别编码区。真核生物生物体的基因结构由启动子、内含子、起始密码子、外显子、终止密码子等组成。剪接位点预测用于分离外显子与内含子之间的连接，尽管其旁侧序列如此。剪接位点具有高度保守性，然而工具的精度却低于 90%。本工作的主要目标是提出一种混合技术，以有效改进现有的基因识别技术。因此，为增强剪接位点的识别，需改进相应算法。过去十年中，研究者更多关注于提高该领域预测模型的准确性。我们提出的方法 SpliceCombo 包含三个阶段。初始阶段考虑基于提取特征的主成分分析。中间阶段即第二阶段进行基于案例的推理，即特征选择。第三阶段使用基于支持向量机及多项式核函数进行最终分类。与其他方法相比，所提 SpliceCombo 模型在预测精度上优于其他预测模型。特别是对于供体剪接位点，该方法灵敏度准确率为 97.25%，特异度为 97.46%。对于受体剪接位点，灵敏度为 96.51%，特异度为 94.48%。