基于未定根STAR方法的基因分裂物种树推断
种群与进化
2016-04-20 v1 统计理论
统计理论
摘要
方法由 Liu 和 Yu 提出，用于从未定根拓扑基因树推断物种树拓扑。尽管其在多物种凝聚模型下的统计一致性仅针对4分类单元树得到证明，但模拟显示其在从多分类单元序列推断的基因树上表现良好。在此，我们证明了该方法对于任意大物种树的统计一致性。我们的方法将 与 Liu、Pearl 和 Edwards 的 STAR 方法的一个推广及其先前的理论分析联系起来。我们进一步表明 仅利用基因树中分裂的分布，而非它们各自的拓扑。最后，我们讨论了每个分类单元每个基因多个样本应如何处理的统计一致性问题。
引用
@article{arxiv.1604.05364,
title = {Species tree inference from gene splits by Unrooted STAR methods},
author = {Elizabeth S. Allman and James H. Degnan and John A. Rhodes},
journal= {arXiv preprint arXiv:1604.05364},
year = {2016}
}
备注
7 pages, 1 figure