修正并合模型下物种系统发育的可辨识性与可重建性
种群与进化
2017-01-25 v1
摘要
进化的并合模型通过指定一个物种树参数来解释不完全谱系排序，该参数决定了基因树上的分布。已证明多物种并合模型的物种树参数的无根拓扑在一般意义下是可辨识的。此外，一种称为SVDQuartets的统计一致重建方法已被开发用于恢复该参数。在本文中，我们描述了一个修正的多物种并合模型，该模型允许有效种群大小变化和违背分子钟。我们证明，对于这些模型，物种树的无根拓扑在一般意义下是可辨识的，且SVDQuartets仍是用于推断该参数的统计一致方法。
引用
@article{arxiv.1701.06871,
title = {Identifiability and Reconstructibility of Species Phylogenies Under a Modified Coalescent},
author = {Colby Long and Laura Kubatko},
journal= {arXiv preprint arXiv:1701.06871},
year = {2017}
}
备注
18 pages, 5 figures