多物种合并模型下节点间距离的方差
种群与进化
2018-12-21 v1 计算工程、金融与科学
概率论
统计理论
统计理论
摘要
我们考虑在存在不完全谱系分选（一种在多基因座数据集中产生基因树异质性的常见现象）时，从未定根基因树拓扑估计物种树的问题。此情形下一类流行的重建方法基于节点间距离，即跨基因树的物种对之间的平均图距离。尽管在基因座数量很大极限下的统计一致性已在部分情形中确立，此类方法的样本复杂度却鲜为人知。本文通过推导节点间距离最坏情形方差的下界在这一问题上取得进展，该下界线性依赖于物种树中相应的图距离。我们还讨论了若干算法层面的启示。
引用
@article{arxiv.1812.08357,
title = {On the variance of internode distance under the multispecies coalescent},
author = {Sebastien Roch},
journal= {arXiv preprint arXiv:1812.08357},
year = {2018}
}