不完全谱系分选：基于多位点的一致系统发育估计
种群与进化
2011-09-30 v2 计算工程、金融与科学
数据结构与算法
概率论
统计理论
统计理论
摘要
我们引入了一种简单的算法，用于在存在不完全谱系分选 (incomplete lineage sorting) 的情况下，从多个基因树重建系统发育树；即当基因树的拓扑结构可能与物种树不同时。我们表明，在标准随机假设下，我们的技术在统计上是一致的，也就是说，给定足够多的非连锁位点，它能返回正确的树。我们还表明，该技术可以容忍适度的估计误差。
引用
@article{arxiv.0710.0262,
title = {Incomplete Lineage Sorting: Consistent Phylogeny Estimation From Multiple Loci},
author = {Elchanan Mossel and Sebastien Roch},
journal= {arXiv preprint arXiv:0710.0262},
year = {2011}
}
评论
Added a section on more general distance-based methods