自调控突发基因表达随机模型中的小蛋白数量效应
亚细胞过程
2020-03-18 v2
摘要
Kumar 等人 [Phys. Rev. Lett. 113, 268105 (2014)] 的自调控突发基因表达随机模型在稳态条件下已被精确求解，其隐含假设是蛋白数量足够大，从而可忽略由可逆蛋白-启动子结合引起的蛋白数量波动。在此我们推导了一个替代模型，该模型考虑了这些波动，因此可用于研究低蛋白数量效应。精确的稳态蛋白数量分布被推导为高斯超几何函数之和。我们利用该理论研究启动子切换速率和反馈类型如何影响蛋白噪声的大小以及噪声诱导的双稳态。此外，我们表明当蛋白均值较小、基因切换较快且蛋白结合快于解离时，我们的模型对蛋白数量分布的预测与 Kumar 等人的模型有显著不同。
引用
@article{arxiv.2001.02441,
title = {Small protein number effects in stochastic models of autoregulated bursty gene expression},
author = {Chen Jia and Ramon Grima},
journal= {arXiv preprint arXiv:2001.02441},
year = {2020}
}
备注
30 pages, 10 figures