基因表达自调控的随机分析
分子网络
2016-07-15 v2
摘要
本文在原核细胞的背景下，分析了当存在通过自调控方案控制基因表达时蛋白质数量的随机变异性。这项工作的目标是估计该调控在限制给定蛋白质拷贝数波动方面的效率。本文考虑的自调控主要依赖于负反馈：蛋白质是其自身基因表达的阻遏物。在假设两者产生相同平均蛋白质数量的条件下，将无反馈控制的生成过程与有基因表达自调控的生成过程进行比较。用于比较的主要特征是平衡时蛋白质数量的标准差。借助马尔可夫表示和简单的阻遏模型，我们证明在缩放机制下，阻遏机制遵循具有双曲控制的希尔阻遏方案。得到了该调控机制下蛋白质数量方差的显式渐近表达式。模拟被用于研究自调控的其他方面，例如生成过程到平衡的收敛速率，以及通过抑制 mRNA 来实现蛋白质生成过程控制的情形。
引用
@article{arxiv.1509.02045,
title = {A Stochastic Analysis of Autoregulation of Gene Expression},
author = {Renaud Dessalles and Vincent Fromion and Philippe Robert},
journal= {arXiv preprint arXiv:1509.02045},
year = {2016}
}