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自调控遗传反馈环的随机建模:综述与比较研究

亚细胞过程 2020-04-22 v1 分子网络

摘要

自调控反馈环是最常见的网络模体之一。人们已构建多种随机模型,以理解这些环中蛋白质数量的涨落如何受主要生化步骤的动力学参数影响。这些模型的不同在于:(i) 哪些亚细胞过程被显式建模;(ii) 所采用的建模方法(离散、连续或混合);(iii) 它们是否能被解析求解蛋白质数量的稳态分布。我们讨论文献中主要模型的假设与性质,总结当前对其相互关系的理解,并强调通过建模获得的一些见解。

关键词

引用

@article{arxiv.1910.08937,
  title  = {Stochastic modeling of auto-regulatory genetic feedback loops: a review and comparative study},
  author = {James Holehouse and Zhixing Cao and Ramon Grima},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1910.08937},
  year   = {2020}
}

备注

12 pages, 3 figures. Submitted to Biophysical Journal