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量化受小 RNA 调控的爆发式基因表达中的噪声

分子网络 2021-10-12 v1

摘要

基因表达是生命系统中的基本过程。小 RNA(sRNA)作为基因表达的全局调控因子被广泛观察到。该调控过程固有的非线性,连同信使 RNA(mRNA)、sRNA 和蛋白质的爆发式产生,使得这一随机过程的精确解难以处理。在量化蛋白质噪声水平时尤其如此,而蛋白质噪声对多种细胞过程有重大影响。在此我们提出一种针对罕见爆发且受 sRNA 强调控的基因表达噪声的近似但相当准确的解析解。该解析解使我们能更好地分析蛋白质水平的噪声与随机偏差。我们发现调控会放大噪声、降低蛋白质水平。调控中的随机性会产生比从系统中移除随机性时更多的蛋白质。sRNA 水平对噪声与随机偏差之间的关系最为重要。这些结果为更一般的基因表达研究提供了分析工具,并加强了我们对转录后调控在控制基因表达过程中的定量理解。

关键词

引用

@article{arxiv.2110.04801,
  title  = {Quantifying the noise in bursty gene expression under regulation by small RNAs},
  author = {Shigang Qiu and Tao Jia},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2110.04801},
  year   = {2021}
}

备注

14 pages, 5 figures