芝麻 (Sesamum indicum L.) 代谢多样性与基因组多样性之间的关系
种群与进化
2014-11-04 v1 基因组学
摘要
背景：栽培植物的多样性评估为保护策略提供了依据，并支持育种计划起始材料的选择。应用于作物的多样性测量通常局限于 DNA 水平的基因组多态性评估。偶尔会记录选定的形态特征并测定关键化学成分的含量，但无偏且全面的化学表型尚未系统地纳入多样性调查。本研究旨在通过非靶向代谢谱分析评估芝麻的代谢多样性，并阐明该作物中代谢多样性与基因组多样性之间的关系。结果：基于先前的 AFLP 研究，选择了十个芝麻种质，代表了印度、西亚、苏丹和委内瑞拉种植的芝麻的大部分基因组多样性。乙醇种子提取物通过 HPLC 分离，代谢物通过正负电喷雾电离，离子在满扫描模式下通过离子阱质谱仪检测，m/z 范围为 50 至 1000。使用八对引物组合，通过扩增片段长度多态性 (AFLP) 测定基因组多样性。通过相关性分析和多元统计评估了基因组水平和代谢组水平的生物多样性之间的关系。结论：基因组水平和代谢水平的多样性模式不同，表明选择在芝麻代谢多样性的进化中发挥了重要作用。这一结果表明，当用于育种和保护中的基因型选择时，基于中性 DNA 标记的多样性评估应辅以代谢谱。我们假设这适用于所有具有长期驯化历史且拥有受化学表型影响的商业相关性状的作物。
引用
@article{arxiv.1411.0101,
title = {Relationship between metabolic and genomic diversity in sesame (Sesamum indicum L.)},
author = {H. Laurentin and A. Ratzinger and P. Karlovsky},
journal= {arXiv preprint arXiv:1411.0101},
year = {2014}
}