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PSICA:用于分类治疗下概率性亚组识别的决策树

机器学习 2018-11-26 v1 机器学习

摘要

精准医学旨在为具有给定特征的患者确定最佳治疗方案。文献表明,与传统上对所有患者开具相同治疗的方法相比,这些方法可在医学上带来显著改善。亚组识别是精准医学的一个分支,旨在寻找具有相似特征的患者亚组,其中所研究的某些治疗比其他治疗具有更好的效果。已有若干基于决策树的方法被提出以识别此类亚组,但大多数聚焦于两臂试验(对照/治疗),少数方法考虑定量治疗(由剂量定义)。然而,在分类治疗集合的场景中,尚不存在能够预测最佳治疗的亚组识别方法。我们提出了一种用于分类治疗场景下亚组识别的新方法。该方法输出一棵决策树,展示给定治疗对给定患者群体为最佳的概率,以及标明可能最佳治疗的标签。该方法已在 CRAN 上提供的 R 包 \textbf{psica} 中实现。除基于人工数据的数值模拟外,我们还展示了一项基于社区的营养干预试验分析,证实了本方法的有效性。

关键词

引用

@article{arxiv.1811.09065,
  title  = {PSICA: decision trees for probabilistic subgroup identification with categorical treatments},
  author = {Oleg Sysoev and Krzysztof Bartoszek and Eva-Charlotte Ekstrom and Katarina Ekholm Selling},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1811.09065},
  year   = {2018}
}