正反馈与温度介导的分子开关控制百日咳博德特菌的差异基因调控
分子网络
2012-11-06 v3 生物物理
亚细胞过程
摘要
基于 BvgAS 双组分系统内的磷酸接力动力学，我们为百日咳博德特菌表型阶段的信号转导与基因调控提出了一个数学框架。所提出的模型识别了 bvg 基因座中两个启动子之间转录干扰的一种新机制。为理解系统在高温下的行为，我们以两种不同方式研究了所建立的模型。首先，对由传感器 BvgS 和响应调节器 BvgA 组成的双组分系统进行了准稳态分析。该准稳态分析揭示了温度诱导的急剧分子开关，导致 BvgA 输出的放大。大量 BvgA 的积累因此导致下游基因（包括编码毒素的基因）的差异调控。随后对全网络动力学进行数值积分，以探索不同系统组分的时间依赖行为，这些行为定性地捕捉了体内实验结果的基本特征。此外，所建立的模型已被用于研究在磷酸化信号网络中转录因子 BvgA 的能力受损的突变体。
引用
@article{arxiv.1106.0466,
title = {Positive feedback and temperature mediated molecular switch controls differential gene regulation in Bordetella pertussis},
author = {Arnab Bandyopadhyay and Suman K. Banik},
journal= {arXiv preprint arXiv:1106.0466},
year = {2012}
}
备注
Final version, 15 pages, 11 figures, 2 tables