折叠路径、成核事件与天然几何构型
生物大分子
2009-11-13 v1
摘要
我们对晶格模型和 Go 势进行了广泛的蒙特卡洛模拟，以研究两种具有显著不同几何构型的天然结构在接触簇形成层面的折叠路径是否存在。我们对折叠路径的分析揭示了一种基于成核现象的共同潜在折叠机制，适用于这两种蛋白质模型。然而，折叠至更复杂的几何构型（即具有更多非局部接触的构型）是由一个几何特征更接近天然折叠的折叠核驱动的。对于这种几何构型，折叠显然是一个更具协同性的过程。
引用
@article{arxiv.0708.0426,
title = {Pathways to folding, nucleation events and native geometry},
author = {Rui D. M. Travasso and M. M. Telo da Gama and P. F. N. Faisca},
journal= {arXiv preprint arXiv:0708.0426},
year = {2009}
}
评论
Accepted in J. Chem. Phys