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利用景观尺度空间显式模型优化反应性病害管理

种群与进化 2019-11-28 v1 动力系统

摘要

全球贸易与旅行的增加以及气候模式的改变,导致全球植物病害流行爆发更为频繁。数学建模是预测这些新威胁将在何处及如何传播的关键工具,也可用于评估其可能造成的损害。模型还可用于指导病害管理,为比较不同可能控制策略的表现提供理性方法。对于新发流行病,即新病原或病原株正主动扩散至新区域时,传播的空间组分在预测与优化病害控制中均尤为重要。在本章中,我们阐释如何通过空间显式区室模型在景观尺度上建模新发植物病害的空间传播。我们特别关注扩散核的关键作用——它参数化病原从感染寄主到任意给定距离处易感寄主的扩散概率——以决定流行结果。我们通过在模型中加入一种简单的“一次性”反应性病害控制形式来测试性能,即在单轮病害管理中清除检测到感染地点特定距离内的位点。我们利用此简化模型展示建模者看似晦涩的决策——最显著的是底层病害模型是否允许随机性(即随机性)——会极大影响病害管理建议。本章附有 R 语言示例代码,可通过在线仓库获取,使读者能自行运行我们所呈现的模型。

关键词

引用

@article{arxiv.1911.12131,
  title  = {Optimising reactive disease management using spatially explicit models at the landscape scale},
  author = {Frédéric Fabre and Jérôme Coville and Nik J. Cunniffe},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1911.12131},
  year   = {2019}
}