有向加权图的最优传输距离：以细胞间通信网络为例

通过最优传输比较图近来受到显著关注，因为最优传输诱导的距离既提供了图之间原则性的度量，也以传输方案的形式给出了图间相关变化的可解释描述。由于对称性缺失给通常考虑的建模带来挑战，图的最优传输距离大多针对无向图发展。此处，我们提出两种基于最优传输变体比较有向图的距离度量：（i）推土机距离（Wasserstein）与（ii）Gromov-Wasserstein（GW）距离。我们在模拟图数据与从单细 RNA-seq 数据推断的真实有向细胞间通信图上评估这两种距离，并讨论其相对性能。