论水合蛋白质的振动自由能
生物大分子
2021-03-16 v1
摘要
当蛋白质的水化层每克蛋白质填充至少 0.6 克水时，观察到能量最小化构象的振动自由能与势能之间存在显著的反相关性。这意味着低势能、充分水化的蛋白质构象往往比高势能构象更刚性。另一方面，对于 CASP 靶标 624，当其水化层被填充时，观察到晶体结构与预测实验期间提出的最佳构象之间存在显著的平均能量差，这强烈表明包含显式水分子可能有助于在看似良好的构象中识别不可能的构象。
引用
@article{arxiv.2010.10313,
title = {On the vibrational free energy of hydrated proteins},
author = {Yves-Henri Sanejouand},
journal= {arXiv preprint arXiv:2010.10313},
year = {2021}
}
备注
8 pages, 7 figures