关于多状态特征兼容性的一个猜想
数据结构与算法
2011-05-06 v1 种群与进化
摘要
确定一组特征兼容性的完美谱系问题已知是NP完全的。本文中,我们提出一个关于兼容性充要条件的猜想:给定一组r态全特征C,存在一个函数f(r),使得C兼容当且仅当C的每个含f(r)个特征的子集均兼容。已有工作表明f(2)=2,f(3)=3,且f(r) ≥ r-1。Gusfield等人于2009年猜想对任意r ≥ 2有f(r) = r。本文中,我们给出一个例子表明f(4) ≥ 5,然后提出弦图夹心图的闭包运算。后一问题是完美谱系的一种常见处理方法。该运算可作为简化问题的第一步,进而求解某些特定情形f(4), f(5), ...,并确定函数f(r)。
引用
@article{arxiv.1105.1109,
title = {On a conjecture of compatibility of multi-states characters},
author = {Michel Habib and Thu-Hien To},
journal= {arXiv preprint arXiv:1105.1109},
year = {2011}
}