推广分裂等价定理与四配子条件：三状态字符的完美系统发育
组合数学
2009-09-18 v2
摘要
我们研究了完美系统发育问题，并建立了三状态字符序列的四配子条件（也称为分裂等价定理）的推广。我们的主要结果是：一组三状态字符的输入序列允许完美系统发育当且仅当每三个字符的子集都允许完美系统发育。在建立这些结果的过程中，我们证明了三状态字符完美系统发育问题的基本结构特征，并完全刻画了在不具有完美系统发育的三状态输入序列中必须出现的最小障碍集。我们进一步给出了一个陈述的下界的证明，该下界涉及将我们的主要结果推广到任意状态数的猜想。这些技术基于完美系统发育的弦图观点。在此之前，冲突图或不兼容图的概念仅针对两状态字符定义。我们对四配子条件的推广使得我们可以将不兼容的概念推广到三状态字符。由此产生的不兼容结构是一个超图，可用于解决算法和理论问题。
引用
@article{arxiv.0905.1417,
title = {Generalizing the Splits Equivalence Theorem and Four Gamete Condition: Perfect Phylogeny on Three State Characters},
author = {Fumei Lam and Dan Gusfield and Srinath Sridhar},
journal= {arXiv preprint arXiv:0905.1417},
year = {2009}
}