生物膜数值方法:协调细分方法与非协调分段线性方法之比较
数值分析
2020-03-31 v2 数值分析
摘要
生物膜的 Canham-Helfrich-Evans 模型由一族几何约束变分问题组成。本文中,我们比较了基于分段线性(PL)曲面和细分曲面(SS)的这两类变分问题数值方法。由于 SS 方法基于样条逼近,可视为 PL 方法的高阶版本,人们可能预期两种方法间的唯一差别在于精度阶数。本文中,我们证明基于最小化文献中提出的任一“PL Willmore 能量”的数值方法将不收敛到连续问题的解,而基于最小化真正 Willmore 能量(对 SS 而非 PL 曲面良定义)的最小化方法则成功。受此分析启发,我们还提出了一种基于共形几何技术的 PL 方法正则化方法。我们处理了若干对求解器效率至关重要的实现问题。名为 Wmincon 的软件包随本文发布,提供了所有相关几何泛函的并行实现。当与标准约束优化求解器结合时,几何变分问题便可被数值求解。为此,我们认识到部分可用的优化算法/求解器能够保持对称性,而另一些则会破坏对称性;我们探讨了这一观察的后果。
引用
@article{arxiv.1901.09990,
title = {Numerical Methods for Biomembranes: conforming subdivision methods versus non-conforming PL methods},
author = {Jingmin Chen and Thomas Yu and Patrick Brogan and Robert Kusner and Yilin Yang and Andrew Zigerelli},
journal= {arXiv preprint arXiv:1901.09990},
year = {2020}
}
备注
35 pages, 17 figures