DNA 复制动力学复合模型中孤子轮廓的数值分析

我们展示了对一个"复合"DNA 模型的数值分析结果，该模型通过允许碱基独立于骨架运动，对 Yakushevich 的著名基本扭转模型进行了推广。该模型与 Yakushevich 模型共享许多特征和结果，但在概念和现象学角度上均有改进。它提供了对 DNA 更真实的描述，并可能为将 DNA 链视为均匀介质的模型提供合理性证明。结果表明，孤子的存在是底层非线性动力学的普遍特征，在很大程度上独立于 DNA 的详细建模。与 Yakushevich 模型不同——在该模型中需要使用非物理的扭转值来诱导正确的声速——我们所考虑的模型在所有表征 DNA 的物理参数的全实际范围内均支持与 Yakushevich 孤子在定性和定量上非常相似的孤子解。