弹性网络中的非线性弛豫动力学与分子机器的设计原理
生物大分子
2007-06-13 v1 软凝聚态物质
化学物理
摘要
通过分析对应于两种经典马达蛋白的弹性网络中的非线性构象弛豫动力学,我们发现它们对各种初始形变会作出明确的内部机械运动响应,并且这些运动对外部扰动具有鲁棒性。我们表明,这种行为并非随机弹性网络的典型特征。然而,具有此类性质的特殊网络架构可以通过进化优化方法来设计。利用这些方法,构建了一个作为由配体结合驱动的循环机器运行的人工弹性网络实例。
引用
@article{arxiv.0705.2504,
title = {Nonlinear Relaxation Dynamics in Elastic Networks and Design Principles of Molecular Machines},
author = {Yuichi Togashi and Alexander S. Mikhailov},
journal= {arXiv preprint arXiv:0705.2504},
year = {2007}
}
备注
12 pages, 9 figures