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fMRI时间序列精度矩阵的噪声清洗

统计力学 2023-02-07 v1 机器学习

摘要

我们针对真实向量小数据集(其典型长度和维度与通过功能磁共振成像(fMRI)获取的人脑活动时间序列相当)中的协方差矩阵和精度矩阵推断算法进行了比较。假设神经活动 underlying 为高斯模型,该问题在于对经验观测矩阵去噪,以获得真实精度矩阵和协方差矩阵的更好估计。我们考虑了几种标准噪声清洗算法,并在两类数据集上进行比较。第一类是静息态人脑fMRI活动的时间序列。第二类是从生成式高斯模型采样的合成时间序列,我们可以改变每个样本的维度比例 q = N/T 以及非对角相关强度。每种算法的可靠性通过测试集似然评估,对于合成数据,还通过其与真实精度矩阵的距离评估。我们观察到,所谓的基于随机矩阵理论的最优旋转不变估计器(Optimal Rotationally Invariant Estimator)在合成数据中与真实精度矩阵的距离显著更低,在自然fMRI数据中测试似然更高。我们提出了一种最优旋转不变估计器的变体,其一个参数通过交叉验证优化。在fMRI序列典型的严重欠采样 regime(大q)下,它优于所有其他估计器。我们进一步提出了一种基于迭代似然梯度上升的简单算法,为弱相关数据集提供准确估计。

关键词

引用

@article{arxiv.2302.02951,
  title  = {Noise-cleaning the precision matrix of fMRI time series},
  author = {Miguel Ibáñez-Berganza and Carlo Lucibello and Francesca Santucci and Tommaso Gili and Andrea Gabrielli},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2302.02951},
  year   = {2023}
}

备注

15 pages, 12 figures (of which 12 pages, 3 figures in the main text)