具有无限与有限自由度的分子系统。第一部分：多尺度分析
生物大分子
2009-09-29 v2 分子网络
摘要
本文分析了描述反应分子系统的随机系统，该系统结合了两类状态空间：有限维部分和无限维部分。典型情况考虑大分子（每个细胞中数量有限，如蛋白质复合物）与较小且极其丰富的分子（如代谢物）之间的相互作用。我们利用 Trotter 近似研究相关主方程（ME）的连续统近似。连续统极限显示有限自由度比无限自由度演化更快的区域。然后我们在有限自由度的马尔可夫链（MC，通常描述大分子的构象变化）以大频率发生的跳跃过程这一条件下，发展了严格的渐近绝热理论。在本工作的第二部分，该理论被用于以替代方式推导典型酶动力学并在此框架下进行诠释。
引用
@article{arxiv.0802.4259,
title = {Molecular Systems with Infinite and Finite Degrees of Freedom. Part I: Multi-Scale Analysis},
author = {L. Sbano and M. Kirkilionis},
journal= {arXiv preprint arXiv:0802.4259},
year = {2009}
}
备注
Corrected typos