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具有无限和有限自由度的分子系统。第二部分:确定性动力学与实例

分子网络 2008-02-29 v1

摘要

本文考虑了具有有限和无限自由度的分子随机系统的确定性极限。获取确定性向量场的方法基于此类微观系统的连续统极限,该极限已在文献 [11] 中推导得出。借助该理论,我们最终为描述典型酶动力学或遗传元件等分子机器与较小通讯分子之间相互作用的分子系统开发了一种新方法。与关于酶动力学的文献不同,由此产生的确定性函数响应并非源自宏观层面的时间尺度论证,而是离散微观层面时间缩放跃迁速率的结果。我们展示了文献中发现的几种常见函数响应实例,如 Michaelis-Menten 方程和 Hill 方程。最后,我们给出了更复杂但典型的宏分子机器的实例。

关键词

引用

@article{arxiv.0802.4279,
  title  = {Molecular Systems with Infinite and Finite Degrees of Freedom. Part II: Deterministic Dynamics and Examples},
  author = {L. Sbano and M. Kirkilionis},
  journal= {arXiv preprint arXiv:0802.4279},
  year   = {2008}
}