连续时间下细胞的随机二元建模：生化反应方程的一种替代方案
分子网络
2015-05-28 v1
摘要
我们开发了一种粗粒化公式，用于基于随机性和异质性而非生化反应来定量建模细胞的动态行为。我们将每个反应视为一个连续时间随机过程，同时将每个生化量在单个细胞层面简化为一个二元值。该系统可以用一组有限的常系数线性微分方程解析表示，从而提供每个分子状态的连续时间过程预测。在这封信中，我们介绍了我们的形式体系，并通过几个例子进行了演示。
引用
@article{arxiv.1107.4449,
title = {Stochastic Binary Modeling of Cells in Continuous Time as an Alternative to Biochemical Reaction Equations},
author = {Shunsuke Teraguchi and Yutaro Kumagai and Alexis Vandenbon and Shizuo Akira and Daron M Standley},
journal= {arXiv preprint arXiv:1107.4449},
year = {2015}
}
备注
10pages, 3 figures