大型蛋白质相互作用网络中复合物形成与解离的生成泛函分析

我们利用无序多粒子系统非平衡统计力学的技术，分析了大型蛋白质相互作用系统。除了蛋白质的产生和去除，蛋白质组中最相关的微观过程是复合物的形成与解离，微观自由度是未结合蛋白质（处于多种翻译后状态）和蛋白质复合物浓度的演化。为数学简化，我们仅考虑二聚体复合物，并从具有任意度分布的随机图集合中抽取描述哪些蛋白质是反应伙伴的网络。我们展示了如何成功使用生成泛函分析方法推导动力学序参量的封闭方程，这代表了无限系统极限下复合物形成与解离动力学的精确宏观描述。本文最后讨论了求解非平凡序参量方程的可能途径，无论是精确求解（在特定极限下）还是近似求解。