果蝇中 polycomb 依赖的染色体相互作用的建模与模拟
亚细胞过程
2007-05-23 v1
摘要
处于 Rabl 构型的核内染色体条件已被建模为受限条件下的自避聚合物链。为确保染色体保持拉伸并排成一列，我们将其端点固定于两相对壁上。段数 、固定点间距离 和 ，以及壁到壁距离 （以段长计量）决定了 Kuhn 段长 的近似值。我们利用分子动力学模拟了染色体的运动，以获得在无进一步吸引或排斥力时遗传位点之间的期望距离分布。与对 \textit{Drosophila Melanogaster} 的生物学实验比较，可得我们模型参数的信息。利用正确参数，可推断导致配对的吸引的强度与范围。
引用
@article{arxiv.q-bio/0511008,
title = {Modelling and simulation of polycomb-dependent chromosomal interactions in drosophila},
author = {S. Ritter and J. Odenheimer and D. W. Heermann and F. Bantignies and C. Grimaud and G. Cavalli},
journal= {arXiv preprint arXiv:q-bio/0511008},
year = {2007}
}