稀有重组事件在黑腹果蝇平衡染色体间产生序列多样性
基因组学
2016-04-22 v1
摘要
具有多重倒位、能抑制与其同源染色体交换的平衡染色体，是黑腹果蝇遗传工具包的重要组成部分。尽管其使用广泛，平衡染色体的组织方式尚未在分子水平被表征，并且任何给定平衡染色体拷贝间的序列变异程度未知。为了定位倒位断点并研究结构相同平衡染色体后代中的潜在序列多样性，我们对一组含有最广泛使用的X染色体平衡染色体First Multiple 7 (FM7)的实验室品系进行了测序。我们将FM7断点的位置定位到精确的常染色质坐标，并鉴定了异染色质区域中断点两侧的序列。对SNP变异的分析揭示了当前使用的FM7品系间存在兆碱基规模的序列分歧区块。我们提供的证据表明，这种分歧由罕见的双交叉事件引起，这些事件将FM7c上singed基因的雌性不育等位基因(sn[X2])替换为来自平衡染色体的野生型序列，并推测布卢明顿果蝇库存中心的许多FM7c染色体已通过该机制丢失了sn[X2]。最后，我们表征了FM7所携带的Bar基因原始等位基因(B[1])，并验证了B1重复序列的起源及随后回复突变是由不等交换介导的假说。我们的结果否定了平衡染色体实验室进化的简单非重组克隆模式，并对如何在果蝇遗传实验的设计与解释中使用平衡染色体具有启示意义。
引用
@article{arxiv.1511.04997,
title = {Rare recombination events generate sequence diversity among balancer chromosomes in Drosophila melanogaster},
author = {Danny E. Miller and Kevin R. Cook and Nazanin Yeganehkazemi and Clarissa B. Smith and Alexandria J. Cockrell and R. Scott Hawley and Casey M. Bergman},
journal= {arXiv preprint arXiv:1511.04997},
year = {2016}
}
备注
40 pages, 3 figures, 4 supplemental files available on request