果蝇的无性基因组
种群与进化
2017-11-30 v1
摘要
重组速率影响分子进化的模式。在高重组序列中，选择的对象是个体的遗传位点；在低重组下，选择集体作用于大片段、遗传连锁的基因组区域。连锁下的选择可诱导克隆干扰——一种群体内遗传 clade 竞争进化的特定模式。该模式在无菌进化的微生物中广为人知，但尚未在专性有性生物中被系统追踪。此处我们表明，果蝇基因组被划分为两种进化模式：具有有限遗传连锁效应的局部干扰体制，以及具有克隆竞争的干扰凝聚态。我们通过突变频率谱的差异来绘制这些模式，并表明它们之间的转变发生在可由基因组汇总统计量预测的阈值重组速率处。我们在低重组序列区段中发现干扰凝聚态，这些区段主要位于着丝粒两侧的染色体区域，覆盖约 20% 的果蝇基因组。凝聚态区域具有影响基因功能的无性进化特征：选择效能与进化速度低于局部干扰区域，而遗传负荷更高。我们的结果表明，多细胞真核生物可在一个基因组内承载异质的进化模式与节奏。我们认为这种变异对基因组结构产生选择压力。
引用
@article{arxiv.1711.10849,
title = {The asexual genome of Drosophila},
author = {Stephan Schiffels and Ville Mustonen and Michael Lässig},
journal= {arXiv preprint arXiv:1711.10849},
year = {2017}
}