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有性群体中克隆的出现

种群与进化 2015-06-05 v2 统计力学

摘要

在有性群体中,重组会重新组合遗传变异并产生现有等位基因的新组合,而选择则会放大群体中最适合的基因型。如果重组比选择更快,群体将由多种基因型的多样化混合组成,正如在许多群体中观察到的那样。在相反的情况下,例如在仅有一部分生殖周期中进行异交的兼性有性群体中,选择可以将单个基因型放大为大型克隆。当某些基因型的适应度优势足够大,以至于它们尽管被重组破坏,仍能增长到群体的显著比例时,这些克隆就会出现。这种“克隆凝聚”的发生除了取决于异交率外,还取决于适应度的遗传力。克隆凝聚导致群体强烈的遗传异质性,而传统的群体遗传学度量(如连锁不平衡)无法充分描述这种异质性。在这里,我们指出了克隆凝聚与自旋玻璃随机能量模型中的冻结转变之间的相似性。在这种类比指导下,我们明确计算了两个个体在遗传上相同的概率Y,作为模型关键参数的函数。虽然Y是自旋玻璃序参数的类似物,但它也与群体遗传学中的聚合速率密切相关:属于同一克隆的两个个体具有最近的共同祖先。

关键词

引用

@article{arxiv.1205.2059,
  title  = {Emergence of clones in sexual populations},
  author = {Richard A. Neher and Marija Vucelja and Marc Mézard and Boris I. Shraiman},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1205.2059},
  year   = {2015}
}

备注

revised version