遗传相似网络中的克隆大小分布
种群与进化
2008-01-23 v2 统计力学
定量方法
摘要
我们构建遗传相似网络,其中节点为从生物学种群中采样的生物个体。该程序通过利用一种海洋克隆植物的遗传数据构建网络加以说明。网络的一个重要特征是无性系子图的存在,即具有完全相同基因型、构成克隆的生物集合。作为理解塑造这些网络的动态过程的第一步,我们指出一种特定度分布与种群中克隆大小分布之间的关系。我们构建种群动态的动力学模型,聚焦于克隆的动态,并求解所需分布。根据参数值不同,可获得无标度形式和指数衰减形式;当克隆生长为主导过程时得到前者。平均分布由复制最快的种群所呈现的幂律行为主导。
引用
@article{arxiv.q-bio/0608018,
title = {Clone size distributions in networks of genetic similarity},
author = {E. Hernandez-Garcia and A. F. Rozenfeld and V. M. Eguiluz and S. Arnaud-Haond and C. M. Duarte},
journal= {arXiv preprint arXiv:q-bio/0608018},
year = {2008}
}
备注
17 pages, 4 figures. One figure improved and other minor changes. To appear in Physica D