生化反应网络的模型降阶
系统与控制
2012-12-12 v1 软件工程
动力系统
化学物理
分子网络
摘要
本文提出了一种适用于由一般酶动力学（包括质量作用动力学和 Michaelis-Menten 动力学）支配的化学反应网络的模型降阶方法。该模型降阶方法基于描述化学反应网络中复合物图结构的加权拉普拉斯矩阵的 Kron 降阶。我们将该方法应用于酵母糖酵解模型，仿真结果表明，降阶模型中若干关键代谢物的瞬态行为与全阶模型的结果吻合良好。
引用
@article{arxiv.1212.2438,
title = {Model-order reduction of biochemical reaction networks},
author = {Shodhan Rao and Arjan van der Schaft and Karen van Eunen and Barbara M. Bakker and Bayu Jayawardhana},
journal= {arXiv preprint arXiv:1212.2438},
year = {2012}
}
备注
7 pages, 5 figures. arXiv admin note: substantial text overlap with arXiv:1211.6643, arXiv:1110.6078