计算代谢网络中的敲除策略
定量方法
2008-08-28 v1
摘要
给定一个以其代谢物和反应描述的代谢网络，我们的目标是高效地计算阻断给定行为所需的最小反应敲除集。我们描述了一种算法，当网络的基元模式（最小功能子系统）已知时，该算法改进了这些敲除集的计算。我们还描述了一种算法，可直接从网络描述中计算敲除集和包含被阻断反应的基元模式，且其最坏情况计算复杂度优于当前用于这些问题的算法。文中包含了计算结果。
引用
@article{arxiv.0801.0082,
title = {Computing knock out strategies in metabolic networks},
author = {Utz-Uwe Haus and Steffen Klamt and Tamon Stephen},
journal= {arXiv preprint arXiv:0801.0082},
year = {2008}
}
备注
12 pages